যশোর বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়ের উচ্চতর শিক্ষা ও গবেষণার লক্ষ্যে ২০১৪ সালের ফেব্রুয়ারি মাসে ড. এম. এ. ওয়াজেদ মিয়া উচ্চ শিক্ষা ও গবেষণা ইনস্টিটিউট প্রতিষ্ঠিত হয়। বর্তমানে বিশ্ববিদ্যালয়ের কেন্দ্রীয় লাইব্রেরী ভবনের চারতলায় ইনস্টিটিউটের কার্য্ক্রম পরিচালিত হচ্ছে। এই ইনস্টিটিউটটি বোর্ড অব গভর্নেন্স দ্বারা পরিচালিত হয়। যশোর বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়ের বিজ্ঞান ও প্রযুক্তির সকল শাখায় উচ্চতর শিক্ষা ও গবেষণার সুযোগ-সুবিধা সৃষ্টি ও উন্নয়ন এবং দেশ ও জাতির আর্থ-সামাজিক উন্নয়নে কার্যকর প্রযুক্তি উদ্ভাবনে উচ্চতর গবেষণা কার্যক্রম পরিচালনা করে থাকে। একইসঙ্গে এ ইনস্টিটিউট দেশ-বিদেশের দক্ষ বিজ্ঞানী ও গবেষকদের নিয়ে বিশ্ববিদ্যালয়ে সেমিনার, সিম্পোজিয়াম, কনফারেন্স এবং ওর্য়াকসপের গবেষণালব্ধ জ্ঞান প্রকাশনার মাধ্যমে দেশ-বিদেশের বিশ্ববিদ্যালয়ের বিজ্ঞানী ও গবেষকদের মধ্যে গবেষণাকর্মে পারস্পারিক সহযোগীতা এবং বিনিময়ের ক্ষেত্র সৃষ্টি করা এ ইনস্টিটিউটের মুখ্য উদ্দেশ্য। এর অধীনে বিশ্ববিদ্যালয়ের গবেষকদের গবেষণাকর্ম প্রকাশের লক্ষ্যে ‘Journal of Jessore University of Science and Technology’ নামে একটি নিয়মিত গবেষণা প্রবন্ধ প্রকাশিত হচ্ছে। যশোর বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয় এবং দেশের অন্যান্য বিশ্ববিদ্যালয়ের স্বনামধন্য গবেষকদের সমন্বয়ে গঠিত এডিটরিয়াল বোর্ডের মাধ্যমে প্রবন্ধ প্রকাশনার কার্যক্রম পরিচালিত হয়, যেখানে এ বিশ্ববিদ্যালয়ের মাননীয় উপাচার্য প্রধান সম্পাদক এবং অধ্যাপক ড. মোঃ আমিনুর রহমান (পরিচালক, ড. এম. এ ওয়াজেদ মিয়া উচ্চ শিক্ষা ও গবেষণা ইনস্টিটিউট) নির্বাহী সম্পাদক হিসেবে দায়িত্ব পালন করছেন। এ ছাড়া ইনস্টিটিউট কর্তৃক ভাষা কোর্স চালু, উচ্চতর ডিগ্রি কোর্স ও গবেষণা কার্যক্রম চালু করার পরিকল্পনা রয়েছে। ইনস্টিটিউটের পরিচালক হিসেবে দায়িত্বরত আছেন অধ্যাপক ড. মোঃ আমিনুর রহমান, (ফিশারিজ এন্ড মেরিন বায়োসায়েন্স, যবিপ্রবি) ও উপ-পরিচালক হিসেবে দায়িত্বরত আছেন সহকারী অধ্যাপক ড. মোহাম্মদ আবদুর রশিদ (পদার্থবিজ্ঞান বিভাগ)।